हत्यारे की पंथ छाया खिलाड़ियों को दो नायक के बीच चयन करने देती है: नाओ, एक महिला शिनोबी, और यासुके, एक ऐतिहासिक अफ्रीकी समुराई। इस विकल्प ने एकल चरित्र पर ध्यान केंद्रित करके संभावित रूप से लापता सामग्री के बारे में संबंधित प्रशंसकों के बीच चर्चा उत्पन्न की है।
क्रिएटिव डायरेक्टर जोनाथन ड्यूमॉन्ट ने खिलाड़ियों को आश्वासन दिया है कि एक नायक को प्राथमिकता देने से महत्वपूर्ण मिस्ड कंटेंट नहीं होगा। जबकि प्रत्येक चरित्र अद्वितीय उद्घाटन अनुक्रम और व्यक्तिगत कहानी आर्क्स का दावा करता है, खेल की कथा खिलाड़ी की पसंद के लिए अनुकूल है। ड्यूमॉन्ट खुद पात्रों के बीच स्विच करके खेल खेलता है, 2-3 घंटे के लिए दूसरे पर स्विच करने से पहले एक के साथ लगभग 3-5 घंटे बिताता है। वह खिलाड़ियों को अपनी वरीयताओं का पालन करने के लिए प्रोत्साहित करता है, यह कहते हुए: "मुझे विश्वास नहीं है कि आप बहुत कुछ याद करेंगे। यह वास्तव में आपके व्यक्तिगत प्लेस्टाइल के लिए नीचे आता है। आप सोच सकते हैं, 'ठीक है, मैं देखूंगा कि खेल किस चरित्र के आधार पर समायोजित करता है।' प्रत्येक नायक का अपना अनूठा परिचय और समर्पित खोज है, लेकिन मुख्य अनुभव लचीला है।
